ClickHouse/dbms/include/DB/Common/RadixSort.h

258 lines
10 KiB
C
Raw Normal View History

#pragma once
#include <string.h>
#include <malloc.h>
#include <cstdint>
#include <type_traits>
#include <ext/bit_cast.hpp>
#include <DB/Core/Defines.h>
/** Поразрядная сортировка, обладает следующей функциональностью:
* Может сортировать unsigned, signed числа, а также float-ы.
* Может сортировать массив элементов фиксированной длины, которые содержат что-то ещё кроме ключа.
* Настраиваемый размер разряда.
2015-11-23 20:24:54 +00:00
*
* LSB, stable.
* NOTE Для некоторых приложений имеет смысл добавить MSB-radix-sort,
* а также алгоритмы radix-select, radix-partial-sort, radix-get-permutation на его основе.
*/
/** Используется в качестве параметра шаблона. См. ниже.
*/
struct RadixSortMallocAllocator
{
void * allocate(size_t size)
{
return malloc(size);
}
void deallocate(void * ptr, size_t size)
{
return free(ptr);
}
};
/** Преобразование, которое переводит битовое представление ключа в такое целое беззнаковое число,
* что отношение порядка над ключами будет соответствовать отношению порядка над полученными беззнаковыми числами.
* Для float-ов это преобразование делает следующее:
* если выставлен знаковый бит, то переворачивает все остальные биты.
* При этом, NaN-ы оказываются больше всех нормальных чисел.
*/
template <typename KeyBits>
struct RadixSortFloatTransform
{
/// Стоит ли записывать результат в память, или лучше делать его каждый раз заново?
static constexpr bool transform_is_simple = false;
static KeyBits forward(KeyBits x)
{
return x ^ (-((x >> (sizeof(KeyBits) * 8 - 1) | (KeyBits(1) << (sizeof(KeyBits) * 8 - 1)))));
}
static KeyBits backward(KeyBits x)
{
return x ^ (((x >> (sizeof(KeyBits) * 8 - 1)) - 1) | (KeyBits(1) << (sizeof(KeyBits) * 8 - 1)));
}
};
template <typename Float>
struct RadixSortFloatTraits
{
using Element = Float; /// Тип элемента. Это может быть структура с ключём и ещё каким-то payload-ом. Либо просто ключ.
using Key = Float; /// Ключ, по которому нужно сортировать.
using CountType = uint32_t; /// Тип для подсчёта гистограмм. В случае заведомо маленького количества элементов, может быть меньше чем size_t.
/// Тип, в который переводится ключ, чтобы делать битовые операции. Это UInt такого же размера, как ключ.
using KeyBits = typename std::conditional<sizeof(Float) == 8, uint64_t, uint32_t>::type;
static constexpr size_t PART_SIZE_BITS = 8; /// Какими кусочками ключа в количестве бит делать один проход - перестановку массива.
2015-11-21 15:51:09 +00:00
/// Преобразования ключа в KeyBits такое, что отношение порядка над ключём соответствует отношению порядка над KeyBits.
using Transform = RadixSortFloatTransform<KeyBits>;
/// Объект с функциями allocate и deallocate.
/// Может быть использован, например, чтобы выделить память для временного массива на стеке.
/// Для этого сам аллокатор создаётся на стеке.
using Allocator = RadixSortMallocAllocator;
/// Функция получения ключа из элемента массива.
static Key & extractKey(Element & elem) { return elem; }
};
template <typename KeyBits>
struct RadixSortIdentityTransform
{
static constexpr bool transform_is_simple = true;
static KeyBits forward(KeyBits x) { return x; }
static KeyBits backward(KeyBits x) { return x; }
};
template <typename KeyBits>
struct RadixSortSignedTransform
{
static constexpr bool transform_is_simple = true;
static KeyBits forward(KeyBits x) { return x ^ (KeyBits(1) << (sizeof(KeyBits) * 8 - 1)); }
static KeyBits backward(KeyBits x) { return x ^ (KeyBits(1) << (sizeof(KeyBits) * 8 - 1)); }
};
template <typename UInt>
struct RadixSortUIntTraits
{
using Element = UInt;
using Key = UInt;
using CountType = uint32_t;
using KeyBits = UInt;
static constexpr size_t PART_SIZE_BITS = 8;
using Transform = RadixSortIdentityTransform<KeyBits>;
using Allocator = RadixSortMallocAllocator;
/// Функция получения ключа из элемента массива.
static Key & extractKey(Element & elem) { return elem; }
};
template <typename Int>
struct RadixSortIntTraits
{
using Element = Int;
using Key = Int;
using CountType = uint32_t;
using KeyBits = typename std::make_unsigned<Int>::type;
static constexpr size_t PART_SIZE_BITS = 8;
using Transform = RadixSortSignedTransform<KeyBits>;
using Allocator = RadixSortMallocAllocator;
/// Функция получения ключа из элемента массива.
static Key & extractKey(Element & elem) { return elem; }
};
template <typename Traits>
struct RadixSort
{
private:
using Element = typename Traits::Element;
using Key = typename Traits::Key;
using CountType = typename Traits::CountType;
using KeyBits = typename Traits::KeyBits;
static constexpr size_t HISTOGRAM_SIZE = 1 << Traits::PART_SIZE_BITS;
static constexpr size_t PART_BITMASK = HISTOGRAM_SIZE - 1;
static constexpr size_t KEY_BITS = sizeof(Key) * 8;
static constexpr size_t NUM_PASSES = (KEY_BITS + (Traits::PART_SIZE_BITS - 1)) / Traits::PART_SIZE_BITS;
static ALWAYS_INLINE KeyBits getPart(size_t N, KeyBits x)
{
if (Traits::Transform::transform_is_simple)
x = Traits::Transform::forward(x);
return (x >> (N * Traits::PART_SIZE_BITS)) & PART_BITMASK;
}
static KeyBits keyToBits(Key x) { return ext::bit_cast<KeyBits>(x); }
static Key bitsToKey(KeyBits x) { return ext::bit_cast<Key>(x); }
public:
static void execute(Element * arr, size_t size)
{
/// Если массив имеет размер меньше 256, то лучше использовать другой алгоритм.
/// Здесь есть циклы по NUM_PASSES. Очень важно, что они разворачиваются в compile-time.
/// Для каждого из NUM_PASSES кусков бит ключа, считаем, сколько раз каждое значение этого куска встретилось.
CountType histograms[HISTOGRAM_SIZE * NUM_PASSES] = {0};
typename Traits::Allocator allocator;
/// Будем делать несколько проходов по массиву. На каждом проходе, данные перекладываются в другой массив. Выделим этот временный массив.
Element * swap_buffer = reinterpret_cast<Element *>(allocator.allocate(size * sizeof(Element)));
/// Трансформируем массив и вычисляем гистограмму.
for (size_t i = 0; i < size; ++i)
{
if (!Traits::Transform::transform_is_simple)
Traits::extractKey(arr[i]) = bitsToKey(Traits::Transform::forward(keyToBits(Traits::extractKey(arr[i]))));
for (size_t j = 0; j < NUM_PASSES; ++j)
++histograms[j * HISTOGRAM_SIZE + getPart(j, keyToBits(Traits::extractKey(arr[i])))];
}
{
/// Заменяем гистограммы на суммы с накоплением: значение в позиции i равно сумме в предыдущих позициях минус один.
size_t sums[NUM_PASSES] = {0};
for (size_t i = 0; i < HISTOGRAM_SIZE; ++i)
{
for (size_t j = 0; j < NUM_PASSES; ++j)
{
size_t tmp = histograms[j * HISTOGRAM_SIZE + i] + sums[j];
histograms[j * HISTOGRAM_SIZE + i] = sums[j] - 1;
sums[j] = tmp;
}
}
}
/// Перекладываем элементы в порядке начиная от младшего куска бит, и далее делаем несколько проходов по количеству кусков.
for (size_t j = 0; j < NUM_PASSES; ++j)
{
Element * writer = j % 2 ? arr : swap_buffer;
Element * reader = j % 2 ? swap_buffer : arr;
for (size_t i = 0; i < size; ++i)
{
size_t pos = getPart(j, keyToBits(Traits::extractKey(reader[i])));
/// Размещаем элемент на следующей свободной позиции.
auto & dest = writer[++histograms[j * HISTOGRAM_SIZE + pos]];
dest = reader[i];
/// На последнем перекладывании, делаем обратную трансформацию.
if (!Traits::Transform::transform_is_simple && j == NUM_PASSES - 1)
Traits::extractKey(dest) = bitsToKey(Traits::Transform::backward(keyToBits(Traits::extractKey(reader[i]))));
}
}
/// Если число проходов нечётное, то результирующий массив находится во временном буфере. Скопируем его на место исходного массива.
if (NUM_PASSES % 2)
memcpy(arr, swap_buffer, size * sizeof(Element));
allocator.deallocate(swap_buffer, size * sizeof(Element));
}
};
template <typename T>
typename std::enable_if<std::is_unsigned<T>::value && std::is_integral<T>::value, void>::type
radixSort(T * arr, size_t size)
{
return RadixSort<RadixSortUIntTraits<T>>::execute(arr, size);
}
template <typename T>
typename std::enable_if<std::is_signed<T>::value && std::is_integral<T>::value, void>::type
radixSort(T * arr, size_t size)
{
return RadixSort<RadixSortIntTraits<T>>::execute(arr, size);
}
template <typename T>
typename std::enable_if<std::is_floating_point<T>::value, void>::type
radixSort(T * arr, size_t size)
{
return RadixSort<RadixSortFloatTraits<T>>::execute(arr, size);
}