From ec8ca5bf5e00d08ae9668c298dd2e31f886245db Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Chao Ma Date: Wed, 21 Apr 2021 10:32:33 +0800 Subject: [PATCH 1/2] Fix kafka storage does not work with parquet format messages --- .../Formats/Impl/ParquetBlockInputFormat.cpp | 6 ++- tests/integration/test_storage_kafka/test.py | 40 ++++--------------- 2 files changed, 11 insertions(+), 35 deletions(-) diff --git a/src/Processors/Formats/Impl/ParquetBlockInputFormat.cpp b/src/Processors/Formats/Impl/ParquetBlockInputFormat.cpp index 162185e75b8..df264406cfe 100644 --- a/src/Processors/Formats/Impl/ParquetBlockInputFormat.cpp +++ b/src/Processors/Formats/Impl/ParquetBlockInputFormat.cpp @@ -33,7 +33,6 @@ namespace ErrorCodes ParquetBlockInputFormat::ParquetBlockInputFormat(ReadBuffer & in_, Block header_) : IInputFormat(std::move(header_), in_) { - prepareReader(); } Chunk ParquetBlockInputFormat::generate() @@ -41,6 +40,9 @@ Chunk ParquetBlockInputFormat::generate() Chunk res; const Block & header = 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(DB::ReadBuffer&, DB::Block const&, DB::RowInputFormatParams const&, DB::FormatSettings const&)>::operator()(DB::ReadBuffer&, DB::Block const&, DB::RowInputFormatParams const&, DB::FormatSettings const&) @ 0x1df2bdec in /usr/bin/clickhouse - # /contrib/libcxx/include/functional:1867: std::__1::__function::__value_func (DB::ReadBuffer&, DB::Block const&, DB::RowInputFormatParams const&, DB::FormatSettings const&)>::operator()(DB::ReadBuffer&, DB::Block const&, DB::RowInputFormatParams const&, DB::FormatSettings const&) const @ 0x1dd14dbd in /usr/bin/clickhouse - # /contrib/libcxx/include/functional:2473: std::__1::function (DB::ReadBuffer&, DB::Block const&, DB::RowInputFormatParams const&, DB::FormatSettings const&)>::operator()(DB::ReadBuffer&, DB::Block const&, DB::RowInputFormatParams const&, DB::FormatSettings const&) const @ 0x1dd07035 in /usr/bin/clickhouse - # /src/Formats/FormatFactory.cpp:258: DB::FormatFactory::getInputFormat(std::__1::basic_string, std::__1::allocator > 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b'\x50\x41\x52\x31\x15\x04\x15\x10\x15\x14\x4c\x15\x02\x15\x04\x12\x00\x00\x08\x1c\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x00\x15\x06\x15\x0a\x2c\x15\x02\x15\x04\x15\x06\x15\x06\x1c\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x16\x00\x28\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x08\x01\x02\x00\x26\xbc\x01\x1c\x15\x04\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x02\x69\x64\x15\x02\x16\x02\x16\xac\x01\x16\xb4\x01\x26\x38\x26\x08\x1c\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x16\x00\x28\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x04\x15\x08\x15\x0c\x4c\x15\x02\x15\x04\x12\x00\x00\x04\x0c\x00\x00\x00\x00\x15\x00\x15\x06\x15\x0a\x2c\x15\x02\x15\x04\x15\x06\x15\x06\x1c\x36\x00\x28\x04\x00\x00\x00\x00\x18\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x08\x01\x02\x00\x26\xc8\x03\x1c\x15\x02\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x07\x62\x6c\x6f\x63\x6b\x4e\x6f\x15\x02\x16\x02\x16\x6c\x16\x74\x26\xfc\x02\x26\xd4\x02\x1c\x36\x00\x28\x04\x00\x00\x00\x00\x18\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x04\x15\x0c\x15\x10\x4c\x15\x02\x15\x04\x12\x00\x00\x06\x14\x02\x00\x00\x00\x41\x4d\x15\x00\x15\x06\x15\x0a\x2c\x15\x02\x15\x04\x15\x06\x15\x06\x1c\x36\x00\x28\x02\x41\x4d\x18\x02\x41\x4d\x00\x00\x00\x03\x08\x01\x02\x00\x26\xa2\x05\x1c\x15\x0c\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x04\x76\x61\x6c\x31\x15\x02\x16\x02\x16\x68\x16\x70\x26\xde\x04\x26\xb2\x04\x1c\x36\x00\x28\x02\x41\x4d\x18\x02\x41\x4d\x00\x00\x00\x15\x04\x15\x08\x15\x0c\x4c\x15\x02\x15\x04\x12\x00\x00\x04\x0c\x00\x00\x00\x3f\x15\x00\x15\x06\x15\x0a\x2c\x15\x02\x15\x04\x15\x06\x15\x06\x1c\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x16\x00\x28\x04\x00\x00\x00\x3f\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x00\x00\x00\x03\x08\x01\x02\x00\x26\x8a\x07\x1c\x15\x08\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x04\x76\x61\x6c\x32\x15\x02\x16\x02\x16\x84\x01\x16\x8c\x01\x26\xa6\x06\x26\xfe\x05\x1c\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x16\x00\x28\x04\x00\x00\x00\x3f\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x00\x00\x00\x15\x04\x15\x08\x15\x0c\x4c\x15\x02\x15\x04\x12\x00\x00\x04\x0c\x01\x00\x00\x00\x15\x00\x15\x06\x15\x0a\x2c\x15\x02\x15\x04\x15\x06\x15\x06\x1c\x36\x00\x28\x04\x01\x00\x00\x00\x18\x04\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x03\x08\x01\x02\x00\x26\xfe\x08\x1c\x15\x02\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x04\x76\x61\x6c\x33\x15\x02\x16\x02\x16\x6c\x16\x74\x26\xb2\x08\x26\x8a\x08\x1c\x36\x00\x28\x04\x01\x00\x00\x00\x18\x04\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x15\x02\x19\x6c\x35\x00\x18\x06\x73\x63\x68\x65\x6d\x61\x15\x0a\x00\x15\x04\x25\x00\x18\x02\x69\x64\x00\x15\x02\x25\x00\x18\x07\x62\x6c\x6f\x63\x6b\x4e\x6f\x25\x18\x4c\xac\x13\x10\x12\x00\x00\x00\x15\x0c\x25\x00\x18\x04\x76\x61\x6c\x31\x25\x00\x4c\x1c\x00\x00\x00\x15\x08\x25\x00\x18\x04\x76\x61\x6c\x32\x00\x15\x02\x25\x00\x18\x04\x76\x61\x6c\x33\x25\x16\x4c\xac\x13\x08\x12\x00\x00\x00\x16\x02\x19\x1c\x19\x5c\x26\xbc\x01\x1c\x15\x04\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x02\x69\x64\x15\x02\x16\x02\x16\xac\x01\x16\xb4\x01\x26\x38\x26\x08\x1c\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x16\x00\x28\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x18\x08\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x26\xc8\x03\x1c\x15\x02\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x07\x62\x6c\x6f\x63\x6b\x4e\x6f\x15\x02\x16\x02\x16\x6c\x16\x74\x26\xfc\x02\x26\xd4\x02\x1c\x36\x00\x28\x04\x00\x00\x00\x00\x18\x04\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x26\xa2\x05\x1c\x15\x0c\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x04\x76\x61\x6c\x31\x15\x02\x16\x02\x16\x68\x16\x70\x26\xde\x04\x26\xb2\x04\x1c\x36\x00\x28\x02\x41\x4d\x18\x02\x41\x4d\x00\x00\x00\x26\x8a\x07\x1c\x15\x08\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x04\x76\x61\x6c\x32\x15\x02\x16\x02\x16\x84\x01\x16\x8c\x01\x26\xa6\x06\x26\xfe\x05\x1c\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x16\x00\x28\x04\x00\x00\x00\x3f\x18\x04\x00\x00\x00\x3f\x00\x00\x00\x26\xfe\x08\x1c\x15\x02\x19\x35\x04\x00\x06\x19\x18\x04\x76\x61\x6c\x33\x15\x02\x16\x02\x16\x6c\x16\x74\x26\xb2\x08\x26\x8a\x08\x1c\x36\x00\x28\x04\x01\x00\x00\x00\x18\x04\x01\x00\x00\x00\x00\x00\x00\x16\x98\x05\x16\x02\x00\x28\x22\x70\x61\x72\x71\x75\x65\x74\x2d\x63\x70\x70\x20\x76\x65\x72\x73\x69\x6f\x6e\x20\x31\x2e\x35\x2e\x31\x2d\x53\x4e\x41\x50\x53\x48\x4f\x54\x19\x5c\x1c\x00\x00\x1c\x00\x00\x1c\x00\x00\x1c\x00\x00\x1c\x00\x00\x00\xc4\x01\x00\x00\x50\x41\x52\x31', + ], + }, 'AvroConfluent': { 'data_sample': [ avro_confluent_message(cluster.schema_registry_client, From dd619e1e37fef85a44d7646fe89b2cac1bddb341 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Mikhail Filimonov Date: Thu, 13 May 2021 16:03:32 +0200 Subject: [PATCH 2/2] Try to stabilize flapping test --- tests/integration/test_storage_kafka/test.py | 59 ++++++++++---------- 1 file changed, 28 insertions(+), 31 deletions(-) diff --git a/tests/integration/test_storage_kafka/test.py b/tests/integration/test_storage_kafka/test.py index f705788e04e..9e035b4a98a 100644 --- a/tests/integration/test_storage_kafka/test.py +++ b/tests/integration/test_storage_kafka/test.py @@ -2457,8 +2457,8 @@ def test_kafka_csv_with_thread_per_consumer(kafka_cluster): CREATE TABLE test.kafka (key UInt64, value UInt64) ENGINE = Kafka SETTINGS kafka_broker_list = 'kafka1:19092', - kafka_topic_list = 'csv', - kafka_group_name = 'csv', + kafka_topic_list = 'csv_with_thread_per_consumer', + kafka_group_name = 'csv_with_thread_per_consumer', kafka_format = 'CSV', kafka_row_delimiter = '\\n', kafka_num_consumers = 4, @@ -2468,7 +2468,7 @@ def test_kafka_csv_with_thread_per_consumer(kafka_cluster): messages = [] for i in range(50): messages.append('{i}, {i}'.format(i=i)) - kafka_produce('csv', messages) + kafka_produce('csv_with_thread_per_consumer', messages) result = '' while True: @@ -2490,8 +2490,8 @@ def test_kafka_engine_put_errors_to_stream(kafka_cluster): CREATE TABLE test.kafka (i Int64, s String) ENGINE = Kafka SETTINGS kafka_broker_list = 'kafka1:19092', - kafka_topic_list = 'json', - kafka_group_name = 'json', + kafka_topic_list = 'kafka_engine_put_errors_to_stream', + kafka_group_name = 'kafka_engine_put_errors_to_stream', kafka_format = 'JSONEachRow', kafka_max_block_size = 128, kafka_handle_error_mode = 'stream'; @@ -2519,17 +2519,11 @@ def test_kafka_engine_put_errors_to_stream(kafka_cluster): # Unexpected json content for table test.kafka. messages.append(json.dumps({'i': 'n_' + random_string(4), 's': random_string(8)})) - kafka_produce('json', messages) + kafka_produce('kafka_engine_put_errors_to_stream', messages) + instance.wait_for_log_line("Committed offset 128") - while True: - total_rows = instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_data', ignore_error=True) - if total_rows == '64\n': - break - - while True: - total_error_rows = instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_errors', ignore_error=True) - if total_error_rows == '64\n': - break + assert TSV(instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_data')) == TSV('64') + assert TSV(instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_errors')) == TSV('64') instance.query(''' DROP TABLE test.kafka; @@ -2545,8 +2539,15 @@ def gen_malformed_json(): def gen_message_with_jsons(jsons = 10, malformed = 0): s = io.StringIO() + + # we don't care on which position error will be added + # (we skip whole broken message), but we need to be + # sure that at least one error will be added, + # otherwise test will fail. + error_pos = random.randint(0,jsons-1) + for i in range (jsons): - if malformed and random.randint(0,1) == 1: + if malformed and i == error_pos: s.write(gen_malformed_json()) else: s.write(gen_normal_json()) @@ -2562,8 +2563,8 @@ def test_kafka_engine_put_errors_to_stream_with_random_malformed_json(kafka_clus CREATE TABLE test.kafka (i Int64, s String) ENGINE = Kafka SETTINGS kafka_broker_list = 'kafka1:19092', - kafka_topic_list = 'json', - kafka_group_name = 'json', + kafka_topic_list = 'kafka_engine_put_errors_to_stream_with_random_malformed_json', + kafka_group_name = 'kafka_engine_put_errors_to_stream_with_random_malformed_json', kafka_format = 'JSONEachRow', kafka_max_block_size = 100, kafka_poll_max_batch_size = 1, @@ -2591,17 +2592,13 @@ def test_kafka_engine_put_errors_to_stream_with_random_malformed_json(kafka_clus else: messages.append(gen_message_with_jsons(10, 0)) - kafka_produce('json', messages) + kafka_produce('kafka_engine_put_errors_to_stream_with_random_malformed_json', messages) - while True: - total_rows = instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_data', ignore_error=True) - if total_rows == '640\n': - break - - while True: - total_error_rows = instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_errors', ignore_error=True) - if total_error_rows == '64\n': - break + instance.wait_for_log_line("Committed offset 128") + # 64 good messages, each containing 10 rows + assert TSV(instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_data')) == TSV('640') + # 64 bad messages, each containing some broken row + assert TSV(instance.query('SELECT count() FROM test.kafka_errors')) == TSV('64') instance.query(''' DROP TABLE test.kafka; @@ -2847,12 +2844,12 @@ def test_kafka_formats_with_broken_message(kafka_cluster): 15 0 AM 0.5 1 {topic_name} 0 {offset_1} 0 0 AM 0.5 1 {topic_name} 0 {offset_2} '''.format(topic_name=topic_name, offset_0=offsets[0], offset_1=offsets[1], offset_2=offsets[2]) - print(('Checking result\n {result} \n expected \n {expected}\n'.format(result=str(result), expected=str(expected)))) + # print(('Checking result\n {result} \n expected \n {expected}\n'.format(result=str(result), expected=str(expected)))) assert TSV(result) == TSV(expected), 'Proper result for format: {}'.format(format_name) errors_result = instance.query('SELECT raw_message, error FROM test.kafka_errors_{format_name}_mv format JSONEachRow'.format(format_name=format_name)) errors_expected = format_opts['expected'] - print(errors_result.strip()) - print(errors_expected.strip()) + # print(errors_result.strip()) + # print(errors_expected.strip()) assert errors_result.strip() == errors_expected.strip(), 'Proper errors for format: {}'.format(format_name) if __name__ == '__main__':