dbms: moved file [#METR-18778].

This commit is contained in:
Alexey Milovidov 2015-11-15 09:18:43 +03:00
parent 749e54749c
commit 4a537fcb84
2 changed files with 543 additions and 1 deletions

View File

@ -0,0 +1,542 @@
#pragma once
#include <math.h>
#include <common/Common.h>
#include <DB/IO/WriteBuffer.h>
#include <DB/IO/WriteHelpers.h>
#include <DB/IO/ReadBuffer.h>
#include <DB/IO/ReadHelpers.h>
#include <DB/IO/VarInt.h>
#include <DB/Common/HashTable/HashTableAllocator.h>
#include <DB/Common/HashTable/Hash.h>
#include <stats/IntHash.h>
/** Приближённый рассчёт чего-угодно, как правило, построен по следующей схеме:
* - для рассчёта значения X используется некоторая структура данных;
* - в структуру данных добавляются не все значения, а только избранные (согласно некоторому критерию избранности);
* - после обработки всех элементов, структура данных находится в некотором состоянии S;
* - в качестве приближённого значения X возвращается значание, посчитанное по принципу максимального правдоподобия:
* при каком реальном значении X, вероятность нахождения структуры данных в полученном состоянии S максимальна.
*/
/** В частности, то, что описано ниже, можно найти по названию BJKST algorithm.
*/
/** Очень простое хэш-множество для приближённого подсчёта количества уникальных значений.
* Работает так:
* - вставлять можно UInt64;
* - перед вставкой, сначала вычисляется хэш-функция UInt64 -> UInt32;
* - исходное значение не сохраняется (теряется);
* - далее все операции производятся с этими хэшами;
* - хэш таблица построена по схеме:
* - open addressing (один буфер, позиция в буфере вычисляется взятием остатка от деления на его размер);
* - linear probing (если в ячейке уже есть значение, то берётся ячейка, следующая за ней и т. д.);
* - отсутствующее значение кодируется нулём; чтобы запомнить наличие в множестве нуля, используется отдельная переменная типа bool;
* - рост буфера в 2 раза при заполнении более чем на 50%;
* - если в множестве больше UNIQUES_HASH_MAX_SIZE элементов, то из множества удаляются все элементы,
* не делящиеся на 2, и затем все элементы, которые не делятся на 2, не вставляются в множество;
* - если ситуация повторяется, то берутся только элементы делящиеся на 4 и т. п.
* - метод size() возвращает приблизительное количество элементов, которые были вставлены в множество;
* - есть методы для быстрого чтения и записи в бинарный и текстовый вид.
*/
/// Максимальная степень размера буфера перед тем, как значения будут выкидываться
#define UNIQUES_HASH_MAX_SIZE_DEGREE 17
/// Максимальное количество элементов перед тем, как значения будут выкидываться
#define UNIQUES_HASH_MAX_SIZE (1 << (UNIQUES_HASH_MAX_SIZE_DEGREE - 1))
/** Количество младших бит, использующихся для прореживания. Оставшиеся старшие биты используются для определения позиции в хэш-таблице.
* (старшие биты берутся потому что младшие будут постоянными после выкидывания части значений)
*/
#define UNIQUES_HASH_BITS_FOR_SKIP (32 - UNIQUES_HASH_MAX_SIZE_DEGREE)
/// Начальная степень размера буфера
#define UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE 4
/** Эта хэш-функция не самая оптимальная, но состояния UniquesHashSet, посчитанные с ней,
* хранятся много где на дисках (в Метраже), поэтому она продолжает использоваться.
*/
struct UniquesHashSetDefaultHash
{
size_t operator() (UInt64 x) const
{
return intHash32<0>(x);
}
};
template <typename Hash = UniquesHashSetDefaultHash>
class UniquesHashSet : private HashTableAllocatorWithStackMemory<(1 << UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE) * sizeof(UInt32)>
{
private:
typedef UInt64 Value_t;
typedef UInt32 HashValue_t;
typedef HashTableAllocatorWithStackMemory<(1 << UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE) * sizeof(UInt32)> Allocator;
UInt32 m_size; /// Количество элементов
UInt8 size_degree; /// Размер таблицы в виде степени двух
UInt8 skip_degree; /// Пропускать элементы не делящиеся на 2 ^ skip_degree
bool has_zero; /// Хэш-таблица содержит элемент со значением хэш-функции = 0.
HashValue_t * buf;
#ifdef UNIQUES_HASH_SET_COUNT_COLLISIONS
/// Для профилирования.
mutable size_t collisions;
#endif
void alloc(UInt8 new_size_degree)
{
buf = reinterpret_cast<HashValue_t *>(Allocator::alloc((1 << new_size_degree) * sizeof(buf[0])));
size_degree = new_size_degree;
}
void free()
{
if (buf)
{
Allocator::free(buf, buf_size() * sizeof(buf[0]));
buf = nullptr;
}
}
inline size_t buf_size() const { return 1 << size_degree; }
inline size_t max_fill() const { return 1 << (size_degree - 1); }
inline size_t mask() const { return buf_size() - 1; }
inline size_t place(HashValue_t x) const { return (x >> UNIQUES_HASH_BITS_FOR_SKIP) & mask(); }
/// Значение делится на 2 ^ skip_degree
inline bool good(HashValue_t hash) const
{
return hash == ((hash >> skip_degree) << skip_degree);
}
HashValue_t hash(Value_t key) const
{
return Hash()(key);
}
/// Удалить все значения, хэши которых не делятся на 2 ^ skip_degree
void rehash()
{
for (size_t i = 0; i < buf_size(); ++i)
{
if (buf[i] && !good(buf[i]))
{
buf[i] = 0;
--m_size;
}
}
/** После удаления элементов, возможно, освободилось место для элементов,
* которые были помещены дальше, чем нужно, из-за коллизии.
* Надо переместить их.
*/
for (size_t i = 0; i < buf_size(); ++i)
{
if (unlikely(buf[i] && i != place(buf[i])))
{
HashValue_t x = buf[i];
buf[i] = 0;
reinsertImpl(x);
}
}
}
/// Увеличить размер буфера в 2 раза или до new_size_degree, если указана ненулевая.
void resize(size_t new_size_degree = 0)
{
size_t old_size = buf_size();
if (!new_size_degree)
new_size_degree = size_degree + 1;
/// Расширим пространство.
buf = reinterpret_cast<HashValue_t *>(Allocator::realloc(buf, old_size * sizeof(buf[0]), (1 << new_size_degree) * sizeof(buf[0])));
size_degree = new_size_degree;
/** Теперь некоторые элементы может потребоваться переместить на новое место.
* Элемент может остаться на месте, или переместиться в новое место "справа",
* или переместиться левее по цепочке разрешения коллизий, из-за того, что элементы левее него были перемещены в новое место "справа".
* Также имеется особый случай:
* если элемент должен был быть в конце старого буфера, [ x]
* но находится в начале из-за цепочки разрешения коллизий, [o x]
* то после ресайза, он сначала снова окажется не на своём месте, [ xo ]
* и для того, чтобы перенести его куда надо,
* надо будет после переноса всех элементов из старой половинки [ o x ]
* обработать ещё хвостик из цепочки разрешения коллизий сразу после неё [ o x ]
* Именно для этого написано || buf[i] ниже.
*/
for (size_t i = 0; i < old_size || buf[i]; ++i)
{
HashValue_t x = buf[i];
if (!x)
continue;
size_t place_value = place(x);
/// Элемент на своём месте.
if (place_value == i)
continue;
while (buf[place_value] && buf[place_value] != x)
{
++place_value;
place_value &= mask();
#ifdef UNIQUES_HASH_SET_COUNT_COLLISIONS
++collisions;
#endif
}
/// Элемент остался на своём месте.
if (buf[place_value] == x)
continue;
buf[place_value] = x;
buf[i] = 0;
}
}
/// Вставить значение.
void insertImpl(HashValue_t x)
{
if (x == 0)
{
m_size += !has_zero;
has_zero = true;
return;
}
size_t place_value = place(x);
while (buf[place_value] && buf[place_value] != x)
{
++place_value;
place_value &= mask();
#ifdef UNIQUES_HASH_SET_COUNT_COLLISIONS
++collisions;
#endif
}
if (buf[place_value] == x)
return;
buf[place_value] = x;
++m_size;
}
/** Вставить в новый буфер значение, которое было в старом буфере.
* Используется при увеличении размера буфера, а также при чтении из файла.
*/
void reinsertImpl(HashValue_t x)
{
size_t place_value = place(x);
while (buf[place_value])
{
++place_value;
place_value &= mask();
#ifdef UNIQUES_HASH_SET_COUNT_COLLISIONS
++collisions;
#endif
}
buf[place_value] = x;
}
/** Если хэш-таблица достаточно заполнена, то сделать resize.
* Если элементов слишком много - то выкидывать половину, пока их не станет достаточно мало.
*/
void shrinkIfNeed()
{
if (unlikely(m_size > max_fill()))
{
if (m_size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
{
while (m_size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
{
++skip_degree;
rehash();
}
}
else
resize();
}
}
public:
UniquesHashSet() :
m_size(0),
skip_degree(0),
has_zero(false)
{
alloc(UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE);
#ifdef UNIQUES_HASH_SET_COUNT_COLLISIONS
collisions = 0;
#endif
}
UniquesHashSet(const UniquesHashSet & rhs)
: m_size(rhs.m_size), skip_degree(rhs.skip_degree), has_zero(rhs.has_zero)
{
alloc(rhs.size_degree);
memcpy(buf, rhs.buf, buf_size() * sizeof(buf[0]));
}
UniquesHashSet & operator= (const UniquesHashSet & rhs)
{
if (size_degree != rhs.size_degree)
{
free();
alloc(rhs.size_degree);
}
m_size = rhs.m_size;
skip_degree = rhs.skip_degree;
has_zero = rhs.has_zero;
memcpy(buf, rhs.buf, buf_size() * sizeof(buf[0]));
return *this;
}
~UniquesHashSet()
{
free();
}
void insert(Value_t x)
{
HashValue_t hash_value = hash(x);
if (!good(hash_value))
return;
insertImpl(hash_value);
shrinkIfNeed();
}
size_t size() const
{
if (0 == skip_degree)
return m_size;
size_t res = m_size * (1 << skip_degree);
/** Псевдослучайный остаток - для того, чтобы не было видно,
* что количество делится на степень двух.
*/
res += (intHashCRC32(m_size) & ((1 << skip_degree) - 1));
/** Коррекция систематической погрешности из-за коллизий при хэшировании в UInt32.
* Формула fixed_res(res)
* - при каком количестве разных элементов fixed_res,
* при их случайном разбрасывании по 2^32 корзинам,
* получается в среднем res заполненных корзин.
*/
size_t p32 = 1ULL << 32;
size_t fixed_res = round(p32 * (log(p32) - log(p32 - res)));
return fixed_res;
}
void merge(const UniquesHashSet & rhs)
{
if (rhs.skip_degree > skip_degree)
{
skip_degree = rhs.skip_degree;
rehash();
}
if (!has_zero && rhs.has_zero)
{
has_zero = true;
++m_size;
shrinkIfNeed();
}
for (size_t i = 0; i < rhs.buf_size(); ++i)
{
if (rhs.buf[i] && good(rhs.buf[i]))
{
insertImpl(rhs.buf[i]);
shrinkIfNeed();
}
}
}
void write(DB::WriteBuffer & wb) const
{
if (m_size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
throw Poco::Exception("Cannot write UniquesHashSet: too large size_degree.");
DB::writeIntBinary(skip_degree, wb);
DB::writeVarUInt(m_size, wb);
if (has_zero)
{
HashValue_t x = 0;
DB::writeIntBinary(x, wb);
}
for (size_t i = 0; i < buf_size(); ++i)
if (buf[i])
DB::writeIntBinary(buf[i], wb);
}
void read(DB::ReadBuffer & rb)
{
has_zero = false;
DB::readIntBinary(skip_degree, rb);
DB::readVarUInt(m_size, rb);
if (m_size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
throw Poco::Exception("Cannot read UniquesHashSet: too large size_degree.");
free();
UInt8 new_size_degree = m_size <= 1
? UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE
: std::max(UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE, static_cast<int>(log2(m_size - 1)) + 2);
alloc(new_size_degree);
for (size_t i = 0; i < m_size; ++i)
{
HashValue_t x = 0;
DB::readIntBinary(x, rb);
if (x == 0)
has_zero = true;
else
reinsertImpl(x);
}
}
void readAndMerge(DB::ReadBuffer & rb)
{
UInt8 rhs_skip_degree = 0;
DB::readIntBinary(rhs_skip_degree, rb);
if (rhs_skip_degree > skip_degree)
{
skip_degree = rhs_skip_degree;
rehash();
}
size_t rhs_size = 0;
DB::readVarUInt(rhs_size, rb);
if (rhs_size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
throw Poco::Exception("Cannot read UniquesHashSet: too large size_degree.");
if ((1U << size_degree) < rhs_size)
{
UInt8 new_size_degree = std::max(UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE, static_cast<int>(log2(rhs_size - 1)) + 2);
resize(new_size_degree);
}
for (size_t i = 0; i < rhs_size; ++i)
{
HashValue_t x = 0;
DB::readIntBinary(x, rb);
insertHash(x);
}
}
static void skip(DB::ReadBuffer & rb)
{
size_t size = 0;
rb.ignore();
DB::readVarUInt(size, rb);
if (size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
throw Poco::Exception("Cannot read UniquesHashSet: too large size_degree.");
rb.ignore(sizeof(HashValue_t) * size);
}
void writeText(DB::WriteBuffer & wb) const
{
if (m_size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
throw Poco::Exception("Cannot write UniquesHashSet: too large size_degree.");
DB::writeIntText(skip_degree, wb);
wb.write(",", 1);
DB::writeIntText(m_size, wb);
if (has_zero)
wb.write(",0", 2);
for (size_t i = 0; i < buf_size(); ++i)
{
if (buf[i])
{
wb.write(",", 1);
DB::writeIntText(buf[i], wb);
}
}
}
void readText(DB::ReadBuffer & rb)
{
has_zero = false;
DB::readIntText(skip_degree, rb);
DB::assertString(",", rb);
DB::readIntText(m_size, rb);
if (m_size > UNIQUES_HASH_MAX_SIZE)
throw Poco::Exception("Cannot read UniquesHashSet: too large size_degree.");
free();
UInt8 new_size_degree = m_size <= 1
? UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE
: std::max(UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE, static_cast<int>(log2(m_size - 1)) + 2);
alloc(new_size_degree);
for (size_t i = 0; i < m_size; ++i)
{
HashValue_t x = 0;
DB::assertString(",", rb);
DB::readIntText(x, rb);
if (x == 0)
has_zero = true;
else
reinsertImpl(x);
}
}
void insertHash(HashValue_t hash_value)
{
if (!good(hash_value))
return;
insertImpl(hash_value);
shrinkIfNeed();
}
#ifdef UNIQUES_HASH_SET_COUNT_COLLISIONS
size_t getCollisions() const
{
return collisions;
}
#endif
};
#undef UNIQUES_HASH_MAX_SIZE_DEGREE
#undef UNIQUES_HASH_MAX_SIZE
#undef UNIQUES_HASH_BITS_FOR_SKIP
#undef UNIQUES_HASH_SET_INITIAL_SIZE_DEGREE

View File

@ -10,7 +10,7 @@
//#define DBMS_HASH_MAP_DEBUG_RESIZES
#include <DB/Common/Stopwatch.h>
#include <stats/UniquesHashSet.h>
#include <DB/AggregateFunctions/UniquesHashSet.h>
#include <DB/Core/Types.h>
#include <DB/IO/ReadBufferFromFile.h>