Merge

2024-11-22 15:42:02 +00:00 · 2015-08-03 18:54:38 +03:00 · 2015-08-03 18:54:38 +03:00 · a012ab00a8
commit a012ab00a8
parent f651046ac8 3c9e720b6c
7 changed files with 257 additions and 29 deletions
--- a/dbms/include/DB/DataStreams/MergingAggregatedMemoryEfficientBlockInputStream.h
+++ b/dbms/include/DB/DataStreams/MergingAggregatedMemoryEfficientBlockInputStream.h
@ -0,0 +1,110 @@
+#pragma once
+
+#include <DB/Interpreters/Aggregator.h>
+#include <DB/DataStreams/IProfilingBlockInputStream.h>
+
+
+namespace DB
+{
+
+
+/** Доагрегирует потоки блоков, держа в оперативной памяти только по одному блоку из каждого потока.
+  * Это экономит оперативку в случае использования двухуровневой агрегации, где в каждом потоке будет до 256 блоков с частями результата.
+  *
+  * Агрегатные функции в блоках не должны быть финализированы, чтобы их состояния можно было объединить.
+  */
+class MergingAggregatedMemoryEfficientBlockInputStream : public IProfilingBlockInputStream
+{
+public:
+	MergingAggregatedMemoryEfficientBlockInputStream(BlockInputStreams inputs_, const Names & keys_names_,
+		const AggregateDescriptions & aggregates_, bool overflow_row_, bool final_)
+		: aggregator(keys_names_, aggregates_, overflow_row_, 0, OverflowMode::THROW, nullptr, 0, 0),
+		final(final_)
+	{
+		children = inputs_;
+		current_blocks.resize(children.size());
+		overflow_blocks.resize(children.size());
+		is_exhausted.resize(children.size());
+	}
+
+	String getName() const override { return "MergingAggregatedMemorySavvy"; }
+
+	String getID() const override
+	{
+		std::stringstream res;
+		res << "MergingAggregatedMemorySavvy(" << aggregator.getID();
+		for (size_t i = 0, size = children.size(); i < size; ++i)
+			res << ", " << children.back()->getID();
+		res << ")";
+		return res.str();
+	}
+
+protected:
+	Block readImpl() override
+	{
+		/// Если child - RemoteBlockInputStream, то отправляет запрос на все удалённые серверы, инициируя вычисления.
+		if (current_bucket_num == -1)
+			for (auto & child : children)
+				child->readPrefix();
+
+		/// Всё прочитали.
+		if (current_bucket_num > 255)
+			return {};
+
+		/// Читаем следующие блоки для current_bucket_num
+		for (size_t i = 0, size = children.size(); i < size; ++i)
+		{
+			while (!is_exhausted[i] && (!current_blocks[i] || current_blocks[i].info.bucket_num < current_bucket_num))
+			{
+				current_blocks[i] = children[i]->read();
+
+				if (!current_blocks[i])
+				{
+					is_exhausted[i] = true;
+				}
+				else if (current_blocks[i].info.is_overflows)
+				{
+					overflow_blocks[i].swap(current_blocks[i]);
+				}
+			}
+		}
+
+		/// Может быть, нет блоков для current_bucket_num, а все блоки имеют больший bucket_num.
+		Int32 min_bucket_num = 256;
+		for (size_t i = 0, size = children.size(); i < size; ++i)
+			if (!is_exhausted[i] && current_blocks[i].info.bucket_num < min_bucket_num)
+				min_bucket_num = current_blocks[i].info.bucket_num;
+
+		current_bucket_num = min_bucket_num;
+
+		/// Все потоки исчерпаны.
+		if (current_bucket_num > 255)
+			return {};	/// TODO overflow_blocks.
+
+		/// TODO Если есть single_level и two_level блоки.
+
+		/// Объединяем все блоки с current_bucket_num.
+
+		BlocksList blocks_to_merge;
+		for (size_t i = 0, size = children.size(); i < size; ++i)
+			if (current_blocks[i].info.bucket_num == current_bucket_num)
+				blocks_to_merge.emplace_back(std::move(current_blocks[i]));
+
+		Block res = aggregator.mergeBlocks(blocks_to_merge, final);
+
+		++current_bucket_num;
+		return res;
+	}
+
+private:
+	Aggregator aggregator;
+	bool final;
+
+	Int32 current_bucket_num = -1;
+	std::vector<Block> current_blocks;
+	std::vector<UInt8> is_exhausted;
+
+	std::vector<Block> overflow_blocks;
+};
+
+}
--- a/dbms/include/DB/DataStreams/RemoteBlockInputStream.h
+++ b/dbms/include/DB/DataStreams/RemoteBlockInputStream.h
@ -111,6 +111,14 @@ public:
 			parallel_replicas->disconnect();
 	}

+
+	/// Отправляет запрос (инициирует вычисления) раньше, чем read.
+	void readPrefix() override
+	{
+		if (!sent_query)
+			sendQuery();
+	}
+
 protected:
 	/// Отправить на удаленные реплики все временные таблицы
 	void sendExternalTables()
@ -147,19 +155,10 @@ protected:
 	{
 		if (!sent_query)
 		{
-			createParallelReplicas();
+			sendQuery();

 			if (settings.skip_unavailable_shards && 0 == parallel_replicas->size())
-				return Block();
-
-			established = true;
-
-			parallel_replicas->sendQuery(query, "", stage, true);
-
-			established = false;
-			sent_query = true;
-
-			sendExternalTables();
+				return {};
 		}

 		while (true)
@ -280,6 +279,23 @@ protected:
 	}

 private:
+	void sendQuery()
+	{
+		createParallelReplicas();
+
+		if (settings.skip_unavailable_shards && 0 == parallel_replicas->size())
+			return;
+
+		established = true;
+
+		parallel_replicas->sendQuery(query, "", stage, true);
+
+		established = false;
+		sent_query = true;
+
+		sendExternalTables();
+	}
+
 	/// ITable::read requires a Context, therefore we should create one if the user can't supply it
 	static Context & getDefaultContext()
 	{
--- a/dbms/include/DB/Interpreters/Aggregator.h
+++ b/dbms/include/DB/Interpreters/Aggregator.h
@ -674,17 +674,6 @@ typedef SharedPtr<AggregatedDataVariants> AggregatedDataVariantsPtr;
 typedef std::vector<AggregatedDataVariantsPtr> ManyAggregatedDataVariants;


-/** Достать вариант агрегации по его типу. */
-template <typename Method> Method & getDataVariant(AggregatedDataVariants & variants);
-
-#define M(NAME, IS_TWO_LEVEL) \
-	template <> inline decltype(AggregatedDataVariants::NAME)::element_type & getDataVariant<decltype(AggregatedDataVariants::NAME)::element_type>(AggregatedDataVariants & variants) { return *variants.NAME; }
-
-APPLY_FOR_AGGREGATED_VARIANTS(M)
-
-#undef M
-
-
 /** Агрегирует источник блоков.
  */
 class Aggregator
@ -733,11 +722,15 @@ public:
 	  */
 	AggregatedDataVariantsPtr merge(ManyAggregatedDataVariants & data_variants, size_t max_threads);

-	/** Объединить несколько агрегированных блоков в одну структуру данных.
+	/** Объединить поток частично агрегированных блоков в одну структуру данных.
 	  * (Доагрегировать несколько блоков, которые представляют собой результат независимых агрегаций с удалённых серверов.)
 	  */
 	void mergeStream(BlockInputStreamPtr stream, AggregatedDataVariants & result, size_t max_threads);

+	/** Объединить несколько частично агрегированных блоков в один.
+	  */
+	Block mergeBlocks(BlocksList & blocks, bool final);
+
 	using CancellationHook = std::function<bool()>;

 	/** Установить функцию, которая проверяет, можно ли прервать текущую задачу.
@ -974,4 +967,15 @@ protected:
 };


+/** Достать вариант агрегации по его типу. */
+template <typename Method> Method & getDataVariant(AggregatedDataVariants & variants);
+
+#define M(NAME, IS_TWO_LEVEL) \
+	template <> inline decltype(AggregatedDataVariants::NAME)::element_type & getDataVariant<decltype(AggregatedDataVariants::NAME)::element_type>(AggregatedDataVariants & variants) { return *variants.NAME; }
+
+APPLY_FOR_AGGREGATED_VARIANTS(M)
+
+#undef M
+
+
 }
--- a/dbms/include/DB/Interpreters/Settings.h
+++ b/dbms/include/DB/Interpreters/Settings.h
@ -91,6 +91,8 @@ struct Settings
 	M(SettingUInt64, min_count_to_compile, 3) \
 	/** При каком количестве ключей, начинает использоваться двухуровневая агрегация. 0 - никогда не использовать. */ \
 	M(SettingUInt64, group_by_two_level_threshold, 100000) \
+	/** Включён ли экономный по памяти режим распределённой агрегации. */ \
+	M(SettingBool, distributed_aggregation_memory_efficient, false) \
 	\
 	/** Максимальное количество используемых реплик каждого шарда при выполнении запроса */ \
 	M(SettingUInt64, max_parallel_replicas, 1) \
--- a/dbms/src/Core/Block.cpp
+++ b/dbms/src/Core/Block.cpp
@ -141,9 +141,12 @@ void Block::insertUnique(const ColumnWithTypeAndName & elem)

 void Block::erase(size_t position)
 {
+	if (index_by_position.empty())
+		throw Exception("Block is empty", ErrorCodes::POSITION_OUT_OF_BOUND);
+
 	if (position >= index_by_position.size())
 		throw Exception("Position out of bound in Block::erase(), max position = "
-			+ toString(index_by_position.size()), ErrorCodes::POSITION_OUT_OF_BOUND);
+			+ toString(index_by_position.size() - 1), ErrorCodes::POSITION_OUT_OF_BOUND);

 	Container_t::iterator it = index_by_position[position];
 	index_by_name.erase(index_by_name.find(it->name));
@ -177,6 +180,9 @@ void Block::erase(const String & name)

 ColumnWithTypeAndName & Block::getByPosition(size_t position)
 {
+	if (index_by_position.empty())
+		throw Exception("Block is empty", ErrorCodes::POSITION_OUT_OF_BOUND);
+
 	if (position >= index_by_position.size())
 		throw Exception("Position " + toString(position)
 			+ " is out of bound in Block::getByPosition(), max position = "
@ -189,6 +195,9 @@ ColumnWithTypeAndName & Block::getByPosition(size_t position)

 const ColumnWithTypeAndName & Block::getByPosition(size_t position) const
 {
+	if (index_by_position.empty())
+		throw Exception("Block is empty", ErrorCodes::POSITION_OUT_OF_BOUND);
+
 	if (position >= index_by_position.size())
 		throw Exception("Position " + toString(position)
 			+ " is out of bound in Block::getByPosition(), max position = "
--- a/dbms/src/Interpreters/Aggregator.cpp
+++ b/dbms/src/Interpreters/Aggregator.cpp
@ -9,6 +9,7 @@
 #include <DB/DataTypes/DataTypeAggregateFunction.h>
 #include <DB/Columns/ColumnsNumber.h>
 #include <DB/AggregateFunctions/AggregateFunctionCount.h>
+#include <DB/DataStreams/IProfilingBlockInputStream.h>

 #include <DB/Interpreters/Aggregator.h>

@ -1688,6 +1689,66 @@ void Aggregator::mergeStream(BlockInputStreamPtr stream, AggregatedDataVariants
 }


+Block Aggregator::mergeBlocks(BlocksList & blocks, bool final)
+{
+	if (blocks.empty())
+		return {};
+
+	StringRefs key(keys_size);
+	ConstColumnPlainPtrs key_columns(keys_size);
+
+	AggregateColumnsData aggregate_columns(aggregates_size);
+
+	initialize(blocks.front());
+
+	/// Каким способом выполнять агрегацию?
+	for (size_t i = 0; i < keys_size; ++i)
+		key_columns[i] = sample.getByPosition(i).column;
+
+	Sizes key_sizes;
+	AggregatedDataVariants::Type method = chooseAggregationMethod(key_columns, key_sizes);
+
+	/// Временные данные для агрегации.
+	AggregatedDataVariants result;
+
+	/// result будет уничтожать состояния агрегатных функций в деструкторе
+	result.aggregator = this;
+
+	result.init(method);
+	result.keys_size = keys_size;
+	result.key_sizes = key_sizes;
+
+	LOG_TRACE(log, "Merging partially aggregated blocks.");
+
+	for (Block & block : blocks)
+	{
+		if (result.type == AggregatedDataVariants::Type::without_key || block.info.is_overflows)
+			mergeWithoutKeyStreamsImpl(block, result);
+
+	#define M(NAME, IS_TWO_LEVEL) \
+		else if (result.type == AggregatedDataVariants::Type::NAME) \
+			mergeStreamsImpl(block, key_sizes, result.aggregates_pool, *result.NAME, result.NAME->data);
+
+		APPLY_FOR_AGGREGATED_VARIANTS(M)
+	#undef M
+		else if (result.type != AggregatedDataVariants::Type::without_key)
+			throw Exception("Unknown aggregated data variant.", ErrorCodes::UNKNOWN_AGGREGATED_DATA_VARIANT);
+	}
+
+	BlocksList merged_block = convertToBlocks(result, final, 1);
+
+	if (merged_block.size() > 1)	/// TODO overflows
+		throw Exception("Logical error: temporary result is not single-level", ErrorCodes::LOGICAL_ERROR);
+
+	LOG_TRACE(log, "Merged partially aggregated blocks.");
+
+	if (merged_block.empty())
+		return {};
+
+	return merged_block.front();
+}
+
+
 template <typename Method>
 void NO_INLINE Aggregator::destroyImpl(
 	Method & method) const
@ -1769,4 +1830,5 @@ void Aggregator::setCancellationHook(const CancellationHook cancellation_hook)
 	isCancelled = cancellation_hook;
 }

+
 }
--- a/dbms/src/Interpreters/InterpreterSelectQuery.cpp
+++ b/dbms/src/Interpreters/InterpreterSelectQuery.cpp
@ -6,6 +6,7 @@
 #include <DB/DataStreams/MergingSortedBlockInputStream.h>
 #include <DB/DataStreams/AggregatingBlockInputStream.h>
 #include <DB/DataStreams/MergingAggregatedBlockInputStream.h>
+#include <DB/DataStreams/MergingAggregatedMemoryEfficientBlockInputStream.h>
 #include <DB/DataStreams/AsynchronousBlockInputStream.h>
 #include <DB/DataStreams/UnionBlockInputStream.h>
 #include <DB/DataStreams/ParallelAggregatingBlockInputStream.h>
@ -856,14 +857,38 @@ void InterpreterSelectQuery::executeAggregation(ExpressionActionsPtr expression,

 void InterpreterSelectQuery::executeMergeAggregated(bool overflow_row, bool final)
 {
-	/// Склеим несколько источников в один
-	executeUnion();
-
-	/// Теперь объединим агрегированные блоки
 	Names key_names;
 	AggregateDescriptions aggregates;
 	query_analyzer->getAggregateInfo(key_names, aggregates);
-	streams[0] = new MergingAggregatedBlockInputStream(streams[0], key_names, aggregates, overflow_row, final, original_max_threads);
+
+	/** Есть два режима распределённой агрегации.
+	  *
+	  * 1. В разных потоках читать из удалённых серверов блоки.
+	  * Сохранить все блоки в оперативку. Объединить блоки.
+	  * Если агрегация двухуровневая - распараллелить по номерам корзин.
+	  *
+	  * 2. В одном потоке читать по очереди блоки с разных серверов.
+	  * В оперативке хранится только по одному блоку с каждого сервера.
+	  * Если агрегация двухуровневая - последовательно объединяем блоки каждого следующего уровня.
+	  *
+	  * Второй вариант расходует меньше памяти (до 256 раз меньше)
+	  *  в случае двухуровневой агрегации, которая используется для больших результатов после GROUP BY,
+	  *  но при этом может работать медленнее.
+	  */
+
+	if (!settings.distributed_aggregation_memory_efficient)
+	{
+		/// Склеим несколько источников в один, распараллеливая работу.
+		executeUnion();
+
+		/// Теперь объединим агрегированные блоки
+		streams[0] = new MergingAggregatedBlockInputStream(streams[0], key_names, aggregates, overflow_row, final, original_max_threads);
+	}
+	else
+	{
+		streams[0] = new MergingAggregatedMemoryEfficientBlockInputStream(streams, key_names, aggregates, overflow_row, final);
+		streams.resize(1);
+	}
 }