mirror of
https://github.com/ClickHouse/ClickHouse.git
synced 2024-11-18 05:32:52 +00:00
512 lines
20 KiB
C++
512 lines
20 KiB
C++
#pragma once
|
||
|
||
#include <DB/Storages/MarkCache.h>
|
||
#include <DB/Storages/MergeTree/MarkRange.h>
|
||
#include <DB/Storages/MergeTree/MergeTreeData.h>
|
||
#include <DB/DataTypes/IDataType.h>
|
||
#include <DB/DataTypes/DataTypeNested.h>
|
||
#include <DB/DataTypes/DataTypeArray.h>
|
||
#include <DB/Core/NamesAndTypes.h>
|
||
#include <DB/Common/escapeForFileName.h>
|
||
#include <DB/IO/CachedCompressedReadBuffer.h>
|
||
#include <DB/IO/CompressedReadBufferFromFile.h>
|
||
#include <DB/Columns/ColumnArray.h>
|
||
#include <DB/Interpreters/evaluateMissingDefaults.h>
|
||
|
||
|
||
namespace DB
|
||
{
|
||
|
||
|
||
/** Умеет читать данные между парой засечек из одного куска. При чтении последовательных отрезков не делает лишних seek-ов.
|
||
* При чтении почти последовательных отрезков делает seek-и быстро, не выбрасывая содержимое буфера.
|
||
*/
|
||
class MergeTreeReader
|
||
{
|
||
using OffsetColumns = std::map<std::string, ColumnPtr>;
|
||
|
||
public:
|
||
using ValueSizeMap = std::map<std::string, double>;
|
||
|
||
MergeTreeReader(const String & path, /// Путь к куску
|
||
const MergeTreeData::DataPartPtr & data_part, const NamesAndTypesList & columns,
|
||
UncompressedCache * uncompressed_cache, MarkCache * mark_cache,
|
||
MergeTreeData & storage, const MarkRanges & all_mark_ranges,
|
||
size_t aio_threshold, size_t max_read_buffer_size, const ValueSizeMap & avg_value_size_hints = ValueSizeMap{},
|
||
const ReadBufferFromFileBase::ProfileCallback & profile_callback = ReadBufferFromFileBase::ProfileCallback{},
|
||
clockid_t clock_type = CLOCK_MONOTONIC_COARSE)
|
||
: avg_value_size_hints(avg_value_size_hints), path(path), data_part(data_part), columns(columns),
|
||
uncompressed_cache(uncompressed_cache), mark_cache(mark_cache), storage(storage),
|
||
all_mark_ranges(all_mark_ranges), aio_threshold(aio_threshold), max_read_buffer_size(max_read_buffer_size)
|
||
{
|
||
try
|
||
{
|
||
if (!Poco::File(path).exists())
|
||
throw Exception("Part " + path + " is missing", ErrorCodes::NOT_FOUND_EXPECTED_DATA_PART);
|
||
|
||
for (const NameAndTypePair & column : columns)
|
||
addStream(column.name, *column.type, all_mark_ranges, profile_callback, clock_type);
|
||
}
|
||
catch (...)
|
||
{
|
||
storage.reportBrokenPart(data_part->name);
|
||
throw;
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
const ValueSizeMap & getAvgValueSizeHints() const { return avg_value_size_hints; }
|
||
|
||
/** Если столбцов нет в блоке, добавляет их, если есть - добавляет прочитанные значения к ним в конец.
|
||
* Не добавляет столбцы, для которых нет файлов. Чтобы их добавить, нужно вызвать fillMissingColumns.
|
||
* В блоке должно быть либо ни одного столбца из columns, либо все, для которых есть файлы.
|
||
*/
|
||
void readRange(size_t from_mark, size_t to_mark, Block & res)
|
||
{
|
||
try
|
||
{
|
||
size_t max_rows_to_read = (to_mark - from_mark) * storage.index_granularity;
|
||
|
||
/// Указатели на столбцы смещений, общие для столбцов из вложенных структур данных
|
||
/// Если append, все значения nullptr, и offset_columns используется только для проверки, что столбец смещений уже прочитан.
|
||
OffsetColumns offset_columns;
|
||
|
||
for (const NameAndTypePair & it : columns)
|
||
{
|
||
if (streams.end() == streams.find(it.name))
|
||
continue;
|
||
|
||
/// Все столбцы уже есть в блоке. Будем добавлять значения в конец.
|
||
bool append = res.has(it.name);
|
||
|
||
ColumnWithTypeAndName column;
|
||
column.name = it.name;
|
||
column.type = it.type;
|
||
if (append)
|
||
column.column = res.getByName(column.name).column;
|
||
|
||
bool read_offsets = true;
|
||
|
||
/// Для вложенных структур запоминаем указатели на столбцы со смещениями
|
||
if (const DataTypeArray * type_arr = typeid_cast<const DataTypeArray *>(&*column.type))
|
||
{
|
||
String name = DataTypeNested::extractNestedTableName(column.name);
|
||
|
||
if (offset_columns.count(name) == 0)
|
||
offset_columns[name] = append ? nullptr : new ColumnArray::ColumnOffsets_t;
|
||
else
|
||
read_offsets = false; /// на предыдущих итерациях смещения уже считали вызовом readData
|
||
|
||
if (!append)
|
||
column.column = new ColumnArray(type_arr->getNestedType()->createColumn(), offset_columns[name]);
|
||
}
|
||
else if (!append)
|
||
column.column = column.type->createColumn();
|
||
|
||
readData(column.name, *column.type, *column.column, from_mark, max_rows_to_read, 0, read_offsets);
|
||
|
||
if (!append && column.column->size())
|
||
res.insert(column);
|
||
}
|
||
}
|
||
catch (const Exception & e)
|
||
{
|
||
if (e.code() != ErrorCodes::MEMORY_LIMIT_EXCEEDED)
|
||
storage.reportBrokenPart(data_part->name);
|
||
|
||
/// Более хорошая диагностика.
|
||
throw Exception(e.message() + "\n(while reading from part " + path + " from mark " + toString(from_mark) + " to "
|
||
+ toString(to_mark) + ")", e.code());
|
||
}
|
||
catch (...)
|
||
{
|
||
storage.reportBrokenPart(data_part->name);
|
||
|
||
throw;
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
/** Добавляет в блок недостающие столбцы из ordered_names, состоящие из значений по-умолчанию.
|
||
* Недостающие столбцы добавляются в позиции, такие же как в ordered_names.
|
||
* Если был добавлен хотя бы один столбец - то все столбцы в блоке переупорядочиваются как в ordered_names.
|
||
*/
|
||
void fillMissingColumns(Block & res, const Names & ordered_names, const bool always_reorder = false)
|
||
{
|
||
fillMissingColumnsImpl(res, ordered_names, always_reorder);
|
||
}
|
||
|
||
/** То же самое, но всегда переупорядочивает столбцы в блоке, как в ordered_names
|
||
* (даже если не было недостающих столбцов).
|
||
*/
|
||
void fillMissingColumnsAndReorder(Block & res, const Names & ordered_names)
|
||
{
|
||
fillMissingColumnsImpl(res, ordered_names, true);
|
||
}
|
||
|
||
private:
|
||
struct Stream
|
||
{
|
||
MarkCache::MappedPtr marks;
|
||
ReadBuffer * data_buffer;
|
||
std::unique_ptr<CachedCompressedReadBuffer> cached_buffer;
|
||
std::unique_ptr<CompressedReadBufferFromFile> non_cached_buffer;
|
||
std::string path_prefix;
|
||
size_t max_mark_range;
|
||
|
||
Stream(
|
||
const String & path_prefix_, UncompressedCache * uncompressed_cache, MarkCache * mark_cache,
|
||
const MarkRanges & all_mark_ranges, size_t aio_threshold, size_t max_read_buffer_size,
|
||
const ReadBufferFromFileBase::ProfileCallback & profile_callback, clockid_t clock_type)
|
||
: path_prefix(path_prefix_)
|
||
{
|
||
loadMarks(mark_cache);
|
||
size_t max_mark_range = 0;
|
||
|
||
for (size_t i = 0; i < all_mark_ranges.size(); ++i)
|
||
{
|
||
size_t right = all_mark_ranges[i].end;
|
||
|
||
/// Если правая граница лежит внутри блока, то его тоже придется читать.
|
||
if (right < (*marks).size() && (*marks)[right].offset_in_decompressed_block > 0)
|
||
{
|
||
while (right < (*marks).size() && (*marks)[right].offset_in_compressed_file ==
|
||
(*marks)[all_mark_ranges[i].end].offset_in_compressed_file)
|
||
++right;
|
||
}
|
||
|
||
/// Если правее засечек нет, просто используем max_read_buffer_size
|
||
if (right >= (*marks).size() || (right + 1 == (*marks).size() &&
|
||
(*marks)[right].offset_in_compressed_file == (*marks)[all_mark_ranges[i].end].offset_in_compressed_file))
|
||
{
|
||
max_mark_range = max_read_buffer_size;
|
||
break;
|
||
}
|
||
|
||
max_mark_range = std::max(max_mark_range,
|
||
(*marks)[right].offset_in_compressed_file - (*marks)[all_mark_ranges[i].begin].offset_in_compressed_file);
|
||
}
|
||
|
||
size_t buffer_size = std::min(max_read_buffer_size, max_mark_range);
|
||
|
||
size_t estimated_size = 0;
|
||
if (aio_threshold > 0)
|
||
{
|
||
for (const auto & mark_range : all_mark_ranges)
|
||
{
|
||
size_t offset_begin = (*marks)[mark_range.begin].offset_in_compressed_file;
|
||
|
||
size_t offset_end;
|
||
if (mark_range.end < (*marks).size())
|
||
offset_end = (*marks)[mark_range.end].offset_in_compressed_file;
|
||
else
|
||
offset_end = Poco::File(path_prefix + ".bin").getSize();
|
||
|
||
if (offset_end > 0)
|
||
estimated_size += offset_end - offset_begin;
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
if (uncompressed_cache)
|
||
{
|
||
cached_buffer = std::make_unique<CachedCompressedReadBuffer>(
|
||
path_prefix + ".bin", uncompressed_cache, estimated_size, aio_threshold, buffer_size);
|
||
|
||
if (profile_callback)
|
||
cached_buffer->setProfileCallback(profile_callback, clock_type);
|
||
|
||
data_buffer = cached_buffer.get();
|
||
}
|
||
else
|
||
{
|
||
non_cached_buffer = std::make_unique<CompressedReadBufferFromFile>(
|
||
path_prefix + ".bin", estimated_size, aio_threshold, buffer_size);
|
||
|
||
if (profile_callback)
|
||
non_cached_buffer->setProfileCallback(profile_callback, clock_type);
|
||
|
||
data_buffer = non_cached_buffer.get();
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
void loadMarks(MarkCache * cache)
|
||
{
|
||
std::string path = path_prefix + ".mrk";
|
||
|
||
UInt128 key;
|
||
if (cache)
|
||
{
|
||
key = cache->hash(path);
|
||
marks = cache->get(key);
|
||
if (marks)
|
||
return;
|
||
}
|
||
|
||
marks.reset(new MarksInCompressedFile);
|
||
|
||
ReadBufferFromFile buffer(path);
|
||
while (!buffer.eof())
|
||
{
|
||
MarkInCompressedFile mark;
|
||
readIntBinary(mark.offset_in_compressed_file, buffer);
|
||
readIntBinary(mark.offset_in_decompressed_block, buffer);
|
||
marks->push_back(mark);
|
||
}
|
||
|
||
if (cache)
|
||
cache->set(key, marks);
|
||
}
|
||
|
||
void seekToMark(size_t index)
|
||
{
|
||
MarkInCompressedFile mark = (*marks)[index];
|
||
|
||
try
|
||
{
|
||
if (cached_buffer)
|
||
{
|
||
cached_buffer->seek(mark.offset_in_compressed_file, mark.offset_in_decompressed_block);
|
||
}
|
||
if (non_cached_buffer)
|
||
non_cached_buffer->seek(mark.offset_in_compressed_file, mark.offset_in_decompressed_block);
|
||
}
|
||
catch (const Exception & e)
|
||
{
|
||
/// Более хорошая диагностика.
|
||
if (e.code() == ErrorCodes::ARGUMENT_OUT_OF_BOUND)
|
||
throw Exception(e.message() + " (while seeking to mark " + toString(index)
|
||
+ " of column " + path_prefix + "; offsets are: "
|
||
+ toString(mark.offset_in_compressed_file) + " "
|
||
+ toString(mark.offset_in_decompressed_block) + ")", e.code());
|
||
else
|
||
throw;
|
||
}
|
||
}
|
||
};
|
||
|
||
typedef std::map<std::string, std::unique_ptr<Stream> > FileStreams;
|
||
|
||
/// Используется в качестве подсказки, чтобы уменьшить количество реаллокаций при создании столбца переменной длины.
|
||
ValueSizeMap avg_value_size_hints;
|
||
String path;
|
||
MergeTreeData::DataPartPtr data_part;
|
||
FileStreams streams;
|
||
|
||
/// Запрашиваемые столбцы.
|
||
NamesAndTypesList columns;
|
||
|
||
UncompressedCache * uncompressed_cache;
|
||
MarkCache * mark_cache;
|
||
|
||
MergeTreeData & storage;
|
||
MarkRanges all_mark_ranges;
|
||
size_t aio_threshold;
|
||
size_t max_read_buffer_size;
|
||
|
||
void addStream(const String & name, const IDataType & type, const MarkRanges & all_mark_ranges,
|
||
const ReadBufferFromFileBase::ProfileCallback & profile_callback, clockid_t clock_type,
|
||
size_t level = 0)
|
||
{
|
||
String escaped_column_name = escapeForFileName(name);
|
||
|
||
/** Если файла с данными нет - то не будем пытаться открыть его.
|
||
* Это нужно, чтобы можно было добавлять новые столбцы к структуре таблицы без создания файлов для старых кусков.
|
||
*/
|
||
if (!Poco::File(path + escaped_column_name + ".bin").exists())
|
||
return;
|
||
|
||
/// Для массивов используются отдельные потоки для размеров.
|
||
if (const DataTypeArray * type_arr = typeid_cast<const DataTypeArray *>(&type))
|
||
{
|
||
String size_name = DataTypeNested::extractNestedTableName(name)
|
||
+ ARRAY_SIZES_COLUMN_NAME_SUFFIX + toString(level);
|
||
String escaped_size_name = escapeForFileName(DataTypeNested::extractNestedTableName(name))
|
||
+ ARRAY_SIZES_COLUMN_NAME_SUFFIX + toString(level);
|
||
|
||
if (!streams.count(size_name))
|
||
streams.emplace(size_name, std::make_unique<Stream>(
|
||
path + escaped_size_name, uncompressed_cache, mark_cache,
|
||
all_mark_ranges, aio_threshold, max_read_buffer_size, profile_callback, clock_type));
|
||
|
||
addStream(name, *type_arr->getNestedType(), all_mark_ranges, profile_callback, clock_type, level + 1);
|
||
}
|
||
else
|
||
streams.emplace(name, std::make_unique<Stream>(
|
||
path + escaped_column_name, uncompressed_cache, mark_cache,
|
||
all_mark_ranges, aio_threshold, max_read_buffer_size, profile_callback, clock_type));
|
||
}
|
||
|
||
|
||
void readData(const String & name, const IDataType & type, IColumn & column, size_t from_mark, size_t max_rows_to_read,
|
||
size_t level = 0, bool read_offsets = true)
|
||
{
|
||
/// Для массивов требуется сначала десериализовать размеры, а потом значения.
|
||
if (const DataTypeArray * type_arr = typeid_cast<const DataTypeArray *>(&type))
|
||
{
|
||
if (read_offsets)
|
||
{
|
||
Stream & stream = *streams[DataTypeNested::extractNestedTableName(name) + ARRAY_SIZES_COLUMN_NAME_SUFFIX + toString(level)];
|
||
stream.seekToMark(from_mark);
|
||
type_arr->deserializeOffsets(
|
||
column,
|
||
*stream.data_buffer,
|
||
max_rows_to_read);
|
||
}
|
||
|
||
if (column.size())
|
||
{
|
||
ColumnArray & array = typeid_cast<ColumnArray &>(column);
|
||
const size_t required_internal_size = array.getOffsets()[column.size() - 1];
|
||
|
||
if (required_internal_size)
|
||
{
|
||
readData(
|
||
name,
|
||
*type_arr->getNestedType(),
|
||
array.getData(),
|
||
from_mark,
|
||
required_internal_size - array.getData().size(),
|
||
level + 1);
|
||
|
||
/** Исправление для ошибочно записанных пустых файлов с данными массива.
|
||
* Такое бывает после ALTER с добавлением новых столбцов во вложенную структуру данных.
|
||
*/
|
||
size_t read_internal_size = array.getData().size();
|
||
if (required_internal_size != read_internal_size)
|
||
{
|
||
if (read_internal_size != 0)
|
||
LOG_ERROR((&Logger::get("MergeTreeReader")),
|
||
"Internal size of array " + name + " doesn't match offsets: corrupted data, filling with default values.");
|
||
|
||
array.getDataPtr() = dynamic_cast<IColumnConst &>(
|
||
*type_arr->getNestedType()->createConstColumn(
|
||
required_internal_size,
|
||
type_arr->getNestedType()->getDefault())).convertToFullColumn();
|
||
|
||
/** NOTE Можно было бы занулять этот столбец, чтобы он не добавлялся в блок,
|
||
* а впоследствии создавался с более правильными (из определения таблицы) значениями по-умолчанию.
|
||
*/
|
||
}
|
||
}
|
||
}
|
||
}
|
||
else
|
||
{
|
||
Stream & stream = *streams[name];
|
||
double & avg_value_size_hint = avg_value_size_hints[name];
|
||
stream.seekToMark(from_mark);
|
||
type.deserializeBinary(column, *stream.data_buffer, max_rows_to_read, avg_value_size_hint);
|
||
|
||
/// Вычисление подсказки о среднем размере значения.
|
||
size_t column_size = column.size();
|
||
if (column_size)
|
||
{
|
||
double current_avg_value_size = static_cast<double>(column.byteSize()) / column_size;
|
||
|
||
/// Эвристика, чтобы при изменениях, значение avg_value_size_hint быстро росло, но медленно уменьшалось.
|
||
if (current_avg_value_size > avg_value_size_hint)
|
||
avg_value_size_hint = current_avg_value_size;
|
||
else if (current_avg_value_size * 2 < avg_value_size_hint)
|
||
avg_value_size_hint = (current_avg_value_size + avg_value_size_hint * 3) / 4;
|
||
}
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
|
||
void fillMissingColumnsImpl(Block & res, const Names & ordered_names, bool always_reorder)
|
||
{
|
||
try
|
||
{
|
||
/** Для недостающих столбцов из вложенной структуры нужно создавать не столбец пустых массивов, а столбец массивов
|
||
* правильных длин.
|
||
* TODO: Если для какой-то вложенной структуры были запрошены только отсутствующие столбцы, для них вернутся пустые
|
||
* массивы, даже если в куске есть смещения для этой вложенной структуры. Это можно исправить.
|
||
* NOTE: Похожий код есть в Block::addDefaults, но он немного отличается.
|
||
*/
|
||
|
||
/// Сначала запомним столбцы смещений для всех массивов в блоке.
|
||
OffsetColumns offset_columns;
|
||
for (size_t i = 0; i < res.columns(); ++i)
|
||
{
|
||
const ColumnWithTypeAndName & column = res.getByPosition(i);
|
||
if (const ColumnArray * array = typeid_cast<const ColumnArray *>(&*column.column))
|
||
{
|
||
String offsets_name = DataTypeNested::extractNestedTableName(column.name);
|
||
auto & offsets_column = offset_columns[offsets_name];
|
||
|
||
/// Если почему-то есть разные столбцы смещений для одной вложенной структуры, то берём непустой.
|
||
if (!offsets_column || offsets_column->empty())
|
||
offsets_column = array->getOffsetsColumn();
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
auto should_evaluate_defaults = false;
|
||
auto should_sort = always_reorder;
|
||
|
||
for (const auto & requested_column : columns)
|
||
{
|
||
/// insert default values only for columns without default expressions
|
||
if (!res.has(requested_column.name))
|
||
{
|
||
should_sort = true;
|
||
if (storage.column_defaults.count(requested_column.name) != 0)
|
||
{
|
||
should_evaluate_defaults = true;
|
||
continue;
|
||
}
|
||
|
||
ColumnWithTypeAndName column_to_add;
|
||
column_to_add.name = requested_column.name;
|
||
column_to_add.type = requested_column.type;
|
||
|
||
String offsets_name = DataTypeNested::extractNestedTableName(column_to_add.name);
|
||
if (offset_columns.count(offsets_name))
|
||
{
|
||
ColumnPtr offsets_column = offset_columns[offsets_name];
|
||
DataTypePtr nested_type = typeid_cast<DataTypeArray &>(*column_to_add.type).getNestedType();
|
||
size_t nested_rows = offsets_column->empty() ? 0
|
||
: typeid_cast<ColumnUInt64 &>(*offsets_column).getData().back();
|
||
|
||
ColumnPtr nested_column = dynamic_cast<IColumnConst &>(*nested_type->createConstColumn(
|
||
nested_rows, nested_type->getDefault())).convertToFullColumn();
|
||
|
||
column_to_add.column = new ColumnArray(nested_column, offsets_column);
|
||
}
|
||
else
|
||
{
|
||
/** Нужно превратить константный столбец в полноценный, так как в части блоков (из других кусков),
|
||
* он может быть полноценным (а то интерпретатор может посчитать, что он константный везде).
|
||
*/
|
||
column_to_add.column = dynamic_cast<IColumnConst &>(*column_to_add.type->createConstColumn(
|
||
res.rows(), column_to_add.type->getDefault())).convertToFullColumn();
|
||
}
|
||
|
||
res.insert(column_to_add);
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
/// evaluate defaulted columns if necessary
|
||
if (should_evaluate_defaults)
|
||
evaluateMissingDefaults(res, columns, storage.column_defaults, storage.context);
|
||
|
||
/// sort columns to ensure consistent order among all blocks
|
||
if (should_sort)
|
||
{
|
||
Block ordered_block;
|
||
|
||
for (const auto & name : ordered_names)
|
||
if (res.has(name))
|
||
ordered_block.insert(res.getByName(name));
|
||
|
||
std::swap(res, ordered_block);
|
||
}
|
||
}
|
||
catch (const Exception & e)
|
||
{
|
||
/// Более хорошая диагностика.
|
||
throw Exception(e.message() + '\n' + e.getStackTrace().toString()
|
||
+ "\n(while reading from part " + path + ")", e.code());
|
||
}
|
||
}
|
||
};
|
||
|
||
}
|