mirror of
https://github.com/ClickHouse/ClickHouse.git
synced 2024-11-05 15:21:43 +00:00
587 lines
17 KiB
C++
587 lines
17 KiB
C++
#pragma once
|
||
|
||
#include <common/Common.h>
|
||
#include <DB/Common/HyperLogLogBiasEstimator.h>
|
||
#include <DB/Common/CompactArray.h>
|
||
#include <DB/Common/HashTable/Hash.h>
|
||
|
||
#include <DB/IO/ReadBuffer.h>
|
||
#include <DB/IO/WriteBuffer.h>
|
||
#include <DB/IO/ReadHelpers.h>
|
||
#include <DB/IO/WriteHelpers.h>
|
||
#include <DB/Core/Defines.h>
|
||
|
||
#include <cmath>
|
||
#include <cstring>
|
||
|
||
|
||
namespace DB
|
||
{
|
||
namespace ErrorCodes
|
||
{
|
||
extern const int LOGICAL_ERROR;
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
|
||
/// Настройка типа знаменателя.
|
||
enum class DenominatorMode
|
||
{
|
||
Compact, /// Компактный знаменатель
|
||
StableIfBig, /// Устойчивый знаменатель (в случае больших хранилищ, иначе Compact)
|
||
ExactType /// Знаменатель заданного простого типа
|
||
};
|
||
|
||
namespace details
|
||
{
|
||
|
||
/// Look-up table логарифмов от целых чисел для использования в HyperLogLogCounter.
|
||
template<UInt8 K>
|
||
struct LogLUT
|
||
{
|
||
LogLUT()
|
||
{
|
||
log_table[0] = 0.0;
|
||
for (size_t i = 1; i <= M; ++i)
|
||
log_table[i] = log(static_cast<double>(i));
|
||
}
|
||
|
||
double getLog(size_t x) const
|
||
{
|
||
if (x <= M)
|
||
return log_table[x];
|
||
else
|
||
return log(static_cast<double>(x));
|
||
}
|
||
|
||
private:
|
||
static constexpr size_t M = 1 << ((static_cast<unsigned int>(K) <= 12) ? K : 12);
|
||
|
||
double log_table[M + 1];
|
||
};
|
||
|
||
template<UInt8 K> struct MinCounterTypeHelper;
|
||
template<> struct MinCounterTypeHelper<0> { using Type = UInt8; };
|
||
template<> struct MinCounterTypeHelper<1> { using Type = UInt16; };
|
||
template<> struct MinCounterTypeHelper<2> { using Type = UInt32; };
|
||
template<> struct MinCounterTypeHelper<3> { using Type = UInt64; };
|
||
|
||
/// Вспомогательная структура для автоматического определения
|
||
/// минимального размера типа счетчика в зависимости от максимального значения.
|
||
/// Используется там, где нужна максимальная экономия памяти,
|
||
/// например, в HyperLogLogCounter
|
||
template<UInt64 MaxValue> struct MinCounterType
|
||
{
|
||
typedef typename MinCounterTypeHelper<
|
||
(MaxValue >= 1 << 8) +
|
||
(MaxValue >= 1 << 16) +
|
||
(MaxValue >= 1ULL << 32)
|
||
>::Type Type;
|
||
};
|
||
|
||
/** Знаменатель формулы алгоритма HyperLogLog
|
||
*/
|
||
template<UInt8 precision, int max_rank, typename HashValueType, typename DenominatorType,
|
||
DenominatorMode denominator_mode, typename Enable = void>
|
||
class __attribute__ ((packed)) Denominator;
|
||
|
||
namespace
|
||
{
|
||
|
||
/// Возвращает true, если хранилище для рангов большое.
|
||
constexpr bool isBigRankStore(UInt8 precision)
|
||
{
|
||
return precision >= 12;
|
||
}
|
||
|
||
}
|
||
|
||
/** Тип употребляемый для вычисления знаменателя.
|
||
*/
|
||
template <typename HashValueType, typename DenominatorType, DenominatorMode denominator_mode, typename Enable = void>
|
||
struct IntermediateDenominator;
|
||
|
||
template <typename DenominatorType, DenominatorMode denominator_mode>
|
||
struct IntermediateDenominator<UInt32, DenominatorType, denominator_mode, typename std::enable_if<denominator_mode != DenominatorMode::ExactType>::type>
|
||
{
|
||
using Type = double;
|
||
};
|
||
|
||
template <typename DenominatorType, DenominatorMode denominator_mode>
|
||
struct IntermediateDenominator<UInt64, DenominatorType, denominator_mode>
|
||
{
|
||
using Type = long double;
|
||
};
|
||
|
||
template <typename HashValueType, typename DenominatorType>
|
||
struct IntermediateDenominator<HashValueType, DenominatorType, DenominatorMode::ExactType>
|
||
{
|
||
using Type = DenominatorType;
|
||
};
|
||
|
||
/** "Лёгкая" реализация знаменателя формулы HyperLogLog.
|
||
* Занимает минимальный объём памяти, зато вычисления могут быть неустойчивы.
|
||
* Подходит, когда хранилище для рангов небольшое.
|
||
*/
|
||
template<UInt8 precision, int max_rank, typename HashValueType, typename DenominatorType,
|
||
DenominatorMode denominator_mode>
|
||
class __attribute__ ((packed)) Denominator<precision, max_rank, HashValueType, DenominatorType,
|
||
denominator_mode,
|
||
typename std::enable_if<!details::isBigRankStore(precision) || !(denominator_mode == DenominatorMode::StableIfBig)>::type>
|
||
{
|
||
private:
|
||
using T = typename IntermediateDenominator<HashValueType, DenominatorType, denominator_mode>::Type;
|
||
|
||
public:
|
||
Denominator(DenominatorType initial_value)
|
||
: denominator(initial_value)
|
||
{
|
||
}
|
||
|
||
public:
|
||
inline void update(UInt8 cur_rank, UInt8 new_rank)
|
||
{
|
||
denominator -= static_cast<T>(1.0) / (1ULL << cur_rank);
|
||
denominator += static_cast<T>(1.0) / (1ULL << new_rank);
|
||
}
|
||
|
||
inline void update(UInt8 rank)
|
||
{
|
||
denominator += static_cast<T>(1.0) / (1ULL << rank);
|
||
}
|
||
|
||
void clear()
|
||
{
|
||
denominator = 0;
|
||
}
|
||
|
||
DenominatorType get() const
|
||
{
|
||
return denominator;
|
||
}
|
||
|
||
private:
|
||
T denominator;
|
||
};
|
||
|
||
/** "Тяжёлая" версия знаменателя формулы HyperLogLog.
|
||
* Занимает больший объём памяти, чем лёгкая версия, зато вычисления всегда устойчивы.
|
||
* Подходит, когда хранилище для рангов довольно большое.
|
||
*/
|
||
template<UInt8 precision, int max_rank, typename HashValueType, typename DenominatorType,
|
||
DenominatorMode denominator_mode>
|
||
class __attribute__ ((packed)) Denominator<precision, max_rank, HashValueType, DenominatorType,
|
||
denominator_mode,
|
||
typename std::enable_if<details::isBigRankStore(precision) && denominator_mode == DenominatorMode::StableIfBig>::type>
|
||
{
|
||
public:
|
||
Denominator(DenominatorType initial_value)
|
||
{
|
||
rank_count[0] = initial_value;
|
||
}
|
||
|
||
inline void update(UInt8 cur_rank, UInt8 new_rank)
|
||
{
|
||
--rank_count[cur_rank];
|
||
++rank_count[new_rank];
|
||
}
|
||
|
||
inline void update(UInt8 rank)
|
||
{
|
||
++rank_count[rank];
|
||
}
|
||
|
||
void clear()
|
||
{
|
||
memset(rank_count, 0, size * sizeof(UInt32));
|
||
}
|
||
|
||
DenominatorType get() const
|
||
{
|
||
long double val = rank_count[size - 1];
|
||
for (int i = size - 2; i >= 0; --i)
|
||
{
|
||
val /= 2.0;
|
||
val += rank_count[i];
|
||
}
|
||
return val;
|
||
}
|
||
|
||
private:
|
||
static constexpr size_t size = max_rank + 1;
|
||
UInt32 rank_count[size] = { 0 };
|
||
};
|
||
|
||
/** Число хвостовых (младших) нулей.
|
||
*/
|
||
template <typename T>
|
||
struct TrailingZerosCounter;
|
||
|
||
template <>
|
||
struct TrailingZerosCounter<UInt32>
|
||
{
|
||
static int apply(UInt32 val)
|
||
{
|
||
return __builtin_ctz(val);
|
||
}
|
||
};
|
||
|
||
template <>
|
||
struct TrailingZerosCounter<UInt64>
|
||
{
|
||
static int apply(UInt64 val)
|
||
{
|
||
return __builtin_ctzll(val);
|
||
}
|
||
};
|
||
|
||
/** Размер счётчика ранга в битах.
|
||
*/
|
||
template <typename T>
|
||
struct RankWidth;
|
||
|
||
template <>
|
||
struct RankWidth<UInt32>
|
||
{
|
||
static constexpr UInt8 get()
|
||
{
|
||
return 5;
|
||
}
|
||
};
|
||
|
||
template <>
|
||
struct RankWidth<UInt64>
|
||
{
|
||
static constexpr UInt8 get()
|
||
{
|
||
return 6;
|
||
}
|
||
};
|
||
|
||
}
|
||
|
||
/** Поведение класса HyperLogLogCounter.
|
||
*/
|
||
enum class HyperLogLogMode
|
||
{
|
||
Raw, /// Применить алгоритм HyperLogLog без исправления погрешности
|
||
LinearCounting, /// Исправить погрешность по алгоритму LinearCounting
|
||
BiasCorrected, /// Исправить погрешность по алгоритму HyperLogLog++
|
||
FullFeatured /// Исправить погрешность по алгоритму LinearCounting или HyperLogLog++
|
||
};
|
||
|
||
/** Подсчёт уникальных значений алгоритмом HyperLogLog.
|
||
*
|
||
* Теоретическая относительная погрешность ~1.04 / sqrt(2^precision)
|
||
* precision - длина префикса хэш-функции для индекса (число ячеек M = 2^precision)
|
||
* Рекомендуемые значения precision: 3..20
|
||
*
|
||
* Источник: "HyperLogLog: The analysis of a near-optimal cardinality estimation algorithm"
|
||
* (P. Flajolet et al., AOFA '07: Proceedings of the 2007 International Conference on Analysis
|
||
* of Algorithms)
|
||
*/
|
||
template <
|
||
UInt8 precision,
|
||
typename Hash = IntHash32<UInt64>,
|
||
typename HashValueType = UInt32,
|
||
typename DenominatorType = double,
|
||
typename BiasEstimator = TrivialBiasEstimator,
|
||
HyperLogLogMode mode = HyperLogLogMode::FullFeatured,
|
||
DenominatorMode denominator_mode = DenominatorMode::StableIfBig>
|
||
class __attribute__ ((packed)) HyperLogLogCounter : private Hash
|
||
{
|
||
private:
|
||
/// Число ячеек.
|
||
static constexpr size_t bucket_count = 1ULL << precision;
|
||
/// Размер счётчика ранга в битах.
|
||
static constexpr UInt8 rank_width = details::RankWidth<HashValueType>::get();
|
||
|
||
private:
|
||
using Value_t = UInt64;
|
||
using RankStore = DB::CompactArray<HashValueType, rank_width, bucket_count>;
|
||
|
||
public:
|
||
void insert(Value_t value)
|
||
{
|
||
HashValueType hash = getHash(value);
|
||
|
||
/// Разбиваем хэш-значение на два подзначения. Первое из них является номером ячейки
|
||
/// в хранилище для рангов (rank_storage), а со второго вычисляем ранг.
|
||
HashValueType bucket = extractBitSequence(hash, 0, precision);
|
||
HashValueType tail = extractBitSequence(hash, precision, sizeof(HashValueType) * 8);
|
||
UInt8 rank = calculateRank(tail);
|
||
|
||
/// Обновляем максимальный ранг для текущей ячейки.
|
||
update(bucket, rank);
|
||
}
|
||
|
||
UInt32 size() const
|
||
{
|
||
/// Нормализующий коэффициент, входящий в среднее гармоническое.
|
||
static constexpr double alpha_m =
|
||
bucket_count == 2 ? 0.351 :
|
||
bucket_count == 4 ? 0.532 :
|
||
bucket_count == 8 ? 0.626 :
|
||
bucket_count == 16 ? 0.673 :
|
||
bucket_count == 32 ? 0.697 :
|
||
bucket_count == 64 ? 0.709 : 0.7213 / (1 + 1.079 / bucket_count);
|
||
|
||
/** Среднее гармоническое по всем корзинам из величин 2^rank равно:
|
||
* bucket_count / ∑ 2^-rank_i.
|
||
* Величина ∑ 2^-rank_i - это denominator.
|
||
*/
|
||
|
||
double raw_estimate = alpha_m * bucket_count * bucket_count / denominator.get();
|
||
|
||
double final_estimate = fixRawEstimate(raw_estimate);
|
||
|
||
return static_cast<UInt32>(final_estimate + 0.5);
|
||
}
|
||
|
||
void merge(const HyperLogLogCounter & rhs)
|
||
{
|
||
const auto & rhs_rank_store = rhs.rank_store;
|
||
for (HashValueType bucket = 0; bucket < bucket_count; ++bucket)
|
||
update(bucket, rhs_rank_store[bucket]);
|
||
}
|
||
|
||
void read(DB::ReadBuffer & in)
|
||
{
|
||
in.readStrict(reinterpret_cast<char *>(this), sizeof(*this));
|
||
}
|
||
|
||
void readAndMerge(DB::ReadBuffer & in)
|
||
{
|
||
typename RankStore::Reader reader(in);
|
||
while (reader.next())
|
||
{
|
||
const auto & data = reader.get();
|
||
update(data.first, data.second);
|
||
}
|
||
|
||
in.ignore(sizeof(DenominatorCalculatorType) + sizeof(ZerosCounterType));
|
||
}
|
||
|
||
static void skip(DB::ReadBuffer & in)
|
||
{
|
||
in.ignore(sizeof(RankStore) + sizeof(DenominatorCalculatorType) + sizeof(ZerosCounterType));
|
||
}
|
||
|
||
void write(DB::WriteBuffer & out) const
|
||
{
|
||
out.write(reinterpret_cast<const char *>(this), sizeof(*this));
|
||
}
|
||
|
||
/// Запись и чтение в текстовом виде неэффективно (зато совместимо с OLAPServer-ом и Metrage).
|
||
void readText(DB::ReadBuffer & in)
|
||
{
|
||
rank_store.readText(in);
|
||
|
||
zeros = 0;
|
||
denominator.clear();
|
||
for (HashValueType bucket = 0; bucket < bucket_count; ++bucket)
|
||
{
|
||
UInt8 rank = rank_store[bucket];
|
||
if (rank == 0)
|
||
++zeros;
|
||
denominator.update(rank);
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
static void skipText(DB::ReadBuffer & in)
|
||
{
|
||
UInt8 dummy;
|
||
for (size_t i = 0; i < RankStore::size(); ++i)
|
||
{
|
||
if (i != 0)
|
||
DB::assertChar(',', in);
|
||
DB::readIntText(dummy, in);
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
void writeText(DB::WriteBuffer & out) const
|
||
{
|
||
rank_store.writeText(out);
|
||
}
|
||
|
||
private:
|
||
/// Извлечь подмножество битов [begin, end[.
|
||
inline HashValueType extractBitSequence(HashValueType val, UInt8 begin, UInt8 end) const
|
||
{
|
||
return (val >> begin) & ((1ULL << (end - begin)) - 1);
|
||
}
|
||
|
||
/// Ранг = число хвостовых (младших) нулей + 1
|
||
inline UInt8 calculateRank(HashValueType val) const
|
||
{
|
||
if (unlikely(val == 0))
|
||
return max_rank;
|
||
|
||
auto zeros_plus_one = details::TrailingZerosCounter<HashValueType>::apply(val) + 1;
|
||
|
||
if (unlikely(zeros_plus_one) > max_rank)
|
||
return max_rank;
|
||
|
||
return zeros_plus_one;
|
||
}
|
||
|
||
inline HashValueType getHash(Value_t key) const
|
||
{
|
||
return Hash::operator()(key);
|
||
}
|
||
|
||
/// Обновить максимальный ранг для заданной ячейки.
|
||
void update(HashValueType bucket, UInt8 rank)
|
||
{
|
||
typename RankStore::Locus content = rank_store[bucket];
|
||
UInt8 cur_rank = static_cast<UInt8>(content);
|
||
|
||
if (rank > cur_rank)
|
||
{
|
||
if (cur_rank == 0)
|
||
--zeros;
|
||
denominator.update(cur_rank, rank);
|
||
content = rank;
|
||
}
|
||
}
|
||
|
||
double fixRawEstimate(double raw_estimate) const
|
||
{
|
||
if ((mode == HyperLogLogMode::Raw) || ((mode == HyperLogLogMode::BiasCorrected) && BiasEstimator::isTrivial()))
|
||
return raw_estimate;
|
||
else if (mode == HyperLogLogMode::LinearCounting)
|
||
return applyLinearCorrection(raw_estimate);
|
||
else if ((mode == HyperLogLogMode::BiasCorrected) && !BiasEstimator::isTrivial())
|
||
return applyBiasCorrection(raw_estimate);
|
||
else if (mode == HyperLogLogMode::FullFeatured)
|
||
{
|
||
static constexpr bool fix_big_cardinalities = std::is_same<HashValueType, UInt32>::value;
|
||
static constexpr double pow2_32 = 4294967296.0;
|
||
|
||
double fixed_estimate;
|
||
|
||
if (fix_big_cardinalities && (raw_estimate > (pow2_32 / 30.0)))
|
||
fixed_estimate = -pow2_32 * log(1.0 - raw_estimate / pow2_32);
|
||
else
|
||
fixed_estimate = applyCorrection(raw_estimate);
|
||
|
||
return fixed_estimate;
|
||
}
|
||
else
|
||
throw Poco::Exception("Internal error", DB::ErrorCodes::LOGICAL_ERROR);
|
||
}
|
||
|
||
inline double applyCorrection(double raw_estimate) const
|
||
{
|
||
double fixed_estimate;
|
||
|
||
if (BiasEstimator::isTrivial())
|
||
{
|
||
if (raw_estimate <= (2.5 * bucket_count))
|
||
{
|
||
/// Поправка в случае маленкой оценки.
|
||
fixed_estimate = applyLinearCorrection(raw_estimate);
|
||
}
|
||
else
|
||
fixed_estimate = raw_estimate;
|
||
}
|
||
else
|
||
{
|
||
fixed_estimate = applyBiasCorrection(raw_estimate);
|
||
double linear_estimate = applyLinearCorrection(fixed_estimate);
|
||
|
||
if (linear_estimate < BiasEstimator::getThreshold())
|
||
fixed_estimate = linear_estimate;
|
||
}
|
||
|
||
return fixed_estimate;
|
||
}
|
||
|
||
/// Поправка из алгоритма HyperLogLog++.
|
||
/// Источник: "HyperLogLog in Practice: Algorithmic Engineering of a State of The Art
|
||
/// Cardinality Estimation Algorithm".
|
||
/// (S. Heule et al., Proceedings of the EDBT 2013 Conference).
|
||
inline double applyBiasCorrection(double raw_estimate) const
|
||
{
|
||
double fixed_estimate;
|
||
|
||
if (raw_estimate <= (5 * bucket_count))
|
||
fixed_estimate = raw_estimate - BiasEstimator::getBias(raw_estimate);
|
||
else
|
||
fixed_estimate = raw_estimate;
|
||
|
||
return fixed_estimate;
|
||
}
|
||
|
||
/// Подсчет уникальных значений по алгоритму LinearCounting.
|
||
/// Источник: "A Linear-time Probabilistic Counting Algorithm for Database Applications"
|
||
/// (Whang et al., ACM Trans. Database Syst., pp. 208-229, 1990)
|
||
inline double applyLinearCorrection(double raw_estimate) const
|
||
{
|
||
double fixed_estimate;
|
||
|
||
if (zeros != 0)
|
||
fixed_estimate = bucket_count * (log_lut.getLog(bucket_count) - log_lut.getLog(zeros));
|
||
else
|
||
fixed_estimate = raw_estimate;
|
||
|
||
return fixed_estimate;
|
||
}
|
||
|
||
private:
|
||
/// Максимальный ранг.
|
||
static constexpr int max_rank = sizeof(HashValueType) * 8 - precision + 1;
|
||
|
||
/// Хранилище для рангов.
|
||
RankStore rank_store;
|
||
|
||
/// Знаменатель формулы алгоритма HyperLogLog.
|
||
using DenominatorCalculatorType = details::Denominator<precision, max_rank, HashValueType, DenominatorType, denominator_mode>;
|
||
DenominatorCalculatorType denominator{bucket_count};
|
||
|
||
/// Число нулей в хранилище для рангов.
|
||
using ZerosCounterType = typename details::MinCounterType<bucket_count>::Type;
|
||
ZerosCounterType zeros = bucket_count;
|
||
|
||
static details::LogLUT<precision> log_lut;
|
||
|
||
/// Проверки.
|
||
static_assert(precision < (sizeof(HashValueType) * 8), "Invalid parameter value");
|
||
};
|
||
|
||
|
||
/// Определения статических переменных, нужные во время линковки.
|
||
template
|
||
<
|
||
UInt8 precision,
|
||
typename Hash,
|
||
typename HashValueType,
|
||
typename DenominatorType,
|
||
typename BiasEstimator,
|
||
HyperLogLogMode mode,
|
||
DenominatorMode denominator_mode
|
||
>
|
||
details::LogLUT<precision> HyperLogLogCounter
|
||
<
|
||
precision,
|
||
Hash,
|
||
HashValueType,
|
||
DenominatorType,
|
||
BiasEstimator,
|
||
mode,
|
||
denominator_mode
|
||
>::log_lut;
|
||
|
||
|
||
/// Для Metrage, используется лёгкая реализация знаменателя формулы HyperLogLog,
|
||
/// чтобы формат сериализации не изменился.
|
||
using HLL12 = HyperLogLogCounter<
|
||
12,
|
||
IntHash32<UInt64>,
|
||
UInt32,
|
||
double,
|
||
TrivialBiasEstimator,
|
||
HyperLogLogMode::FullFeatured,
|
||
DenominatorMode::Compact
|
||
>;
|